扁平疣留下的色素印最好选择涂抹淡斑药膏，或者是选择皮秒激光手术来去掉效果都比较好。出现浅褐色的色素，最好涂抹淡斑药膏来治疗，药物中还有大量脱失剂，能快速去掉皮肤上的色素，黑色素面积比较大或者是颜色发黑，在影响皮肤美观时可以选择皮秒激光手术来治疗，能快速分解皮下黑色素颗粒。在治疗期间还需要做好皮肤防晒，最好不要接触紫外线。